O Gabedit [1] é um programa gratuito, que possui interface gráfica que possibilita a realização de inúmeras tarefas, que vão da construção de moléculas em 3D dimensões até a submissão de cálculos em diversos programas como: Gamess, Gaussian, Molcas, Molpro, Mopac, MPQC, Orca, NWChem, FireFly, Q-Chem, Psicode. Os cálculos submetidos pela interface do Gabedit podem ser rodados na própria maquina em que ele esta instalado ou em uma maquina remota.
Figura 1. Interface do Gabedit.
Em qualquer laboratório de química computacional, o programa Gabedit esta presente pois ele é o melhor programa gratuito que envolvem química computacional, pois além de gerar inputs específicos para os programas listados, submeter cálculos na própria interface, entre tantos usos, ele gera imagens para variados fins, e estas que se adequam a resolução exigida por diversas revista científicas [2].
Figura 2. Visualização de um cluster de uma MOF contendo 148 átomos otimizada com o programa MOPAC2012 (Nº de deposição: 730465) [3].
Bem a instalação é um processo bastante simples:
1º - Conectado na internet, abra o terminal;
2º - Digite o seguinte comando:
$ sudo apt-get install gabedit
3º - Será pedido sua senha, digite e espere o processo acabar.
O Gabedit esta pronto para ser utilizado. Para abrir o programa, digite no terminal:
$ gabedit
Após digitar, tecle "Enter" e esta pronto para uso. Bom trabalho.
Referencias
[1] A. B, Allouche., Journal of Computational Chemistry. 32 (2011) 174.
[2] N. M. Rodrigues.; E.S. Machado.; N.B. da Costa Jr.; R. O. Freire., Scientia Plena. 9 (2013) 077217-1
[3] D. Deng.; P. Liu.; W. Fu.; L. Li.; F. Yang.; B. Ji., Inorganica Chimica Acta., 363 (2010) 891